醫院始建于1952年,原名永定路醫院。
1989年納入全國第一批中西醫結合醫院,更名為北京市中西醫結合醫院;
2017年獲批三級甲等中西醫結合醫院;
2021年正式更名為北京中西醫結合醫院。歷經70年的歷史積淀,已發展成為一所集醫療、教學、科研、預防保健、康復為一體,以中西醫結合為特色的三級甲等中西醫結合醫院。是國家中醫藥管理局第三批重點建設中西醫結合醫院,海淀區中西醫結合健康養老示范基地和指導中心、海淀區區域中醫醫療中心和中西醫結合醫療中心、海淀區中西醫結合??漆t聯體核心醫院,在海淀區中醫藥創新發展中發揮示范引領作用。